История колледжа уходит корнями в далекий 1893 год. В тот год 7 февраля при Томском отделении Императорского Русского музыкального общества были открыты музыкальные классы. Они стали первым учебным заведением подобного рода, положившим начало профессиональному музыкальному образованию на территории от Урала до Тихого океана. Занятия велись по двум специальностям – фортепиано и скрипки. Фортепиано преподавала М.Ф. Зубова, которую вскоре заменил С.И. Герц (старший курс фортепиано). Класс скрипки возглавил Г.Р. Перковский. На следующий год добавился класс пения, который вел В.И. Розеноэр (также вел теорию музыки и младший курс фортепиано).С тех пор музыкальное учебное заведение претерпело множество переименований и преобразований. Оно называлось музыкальным училищем (с 1912 года), техникумом (1921 – 1936 годы), снова училищем, пока, наконец, в 2009 году стало колледжем. В нем постепенно добавлялись преподаваемые инструменты, открывались новые специальности. Сейчас в музыкальном колледже ведется обучение по пяти специальностям – «Музыкальное образование», «Инструментальное исполнительство», «Вокальное искусство», «Хоровое дирижирование» и «Теория музыки». Студенты специальности «Инструментальное исполнительство» осваивают игру и совершенствуются в исполнительстве на фортепиано, струнных смычковых (скрипка, виолончель, контрабас), духовых (флейта, кларнет, труба, саксофон), ударных (вибрафон, маримба, ксилофон, литавры, малый барабан) инструментах. Баян, аккордеон, домра, балалайка, гитара предоставляются студентам специализации «Инструменты народного оркестра».С первых дней существования в учреждении преподавали высококлассные музыканты. Это были выпускники Московской, Петербургской и Варшавской консерваторий – пианистка Феофания Николаевна Тютрюмова, дирижер Моисей Исаевич Маломет, скрипач Яков Соломонович Медлин. Они заложили основы высокого уровня музыкального образования в Томске, который и по сей день поддерживается преподавателями, концертмейстерами и студентами колледжа. Самой знаменитой личностью, связанной с музыкальным училищем, является его выпускник 1950 года Эдисон Денисов – композитор второй половины ХХ века, музыка которого получила широкое признание во всем мире. Решением Государственной думы Томской области его имя было присвоено училищу в 1999 г.